@iwayajima0114 これ一つ思いついたのですが、ダイナメッシュを掛けるということは、トポロジーは気にしてないということですよね。
なら、気にならない程度に適当な小さなオブジェクトを用意し、「ライブブーリアン」をONにします。
「ツール→サブツール→ブーリアン→ブーリアンメッシュ作成」
で、身体と小オブジェクトが結合された新しいツールができると思うので、そのモデルにダイナメッシュを掛けてみてはどうでしょう。
新しいツールに移動することで、破損データがクリーンナップされる可能性があります。