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@RS Geometryの中にPositionの数値・Scaleの数値がなんらかの影響によって異なっている可能性などもありますが、少し情報が少ないので、画面全体のスクリーンショットなどを提供していただけますか? また、その現象はCubeなどのシンプルな形状でも発生するのか、それとも制作を行っていく上で変形を加えたもののみ発生するのか検証を行ってみてください。
R
教えていただいたとおり、 eFipY , eFlipZ をONにすることで解決いたしました。 何らかの拍子でこの機能が外れてしまっていたようでした・・・ ONにした状態でStore Configを有効にすることで再起動以降も問題なくエクスポートできるようになりました。ありがとうございました。