・ZBrush2019.1.2へ更新
・レイヤーのClear
・タイムラインの解除
・マスクのClear
・ライトボックス>レンダーセット>Default.ZRPをダブルクリック
・キャンバスの倍率が1:1となっていることの確認
・新たにToolを追加してレンダー設定を確認
以上ではすべて問題の再現がありました。
以前保存していたZTLファイルや別のZPRファイルでは問題の再現がなかったため
やはりこのプロジェクトに何か問題があるようです。
そのためPixologicのチケットを作成して問い合わせを行いました。
何か進展があればこちらにもレスを行いたいと思います。