@kizakiaoi 再度返答ありがとうございます
これは自分の察しの悪さと思い込みが原因です
クリースがついた６面体には（＊ついた時点で６面体ではなくなっているのにも関わらず）
４つの角の部分（本来の６面体の頂点にあたる部分）にもエッジがついていることに
あまりにも小さい部分だったこともあり、なかなか見た目で気付くことができなかった・・・ということです
（＊最初から拡大してジッと観察すれば もっと早く気づけたと思います）
あと、この角の部分のクリースを消すためにedge→creaseでは消せず、
point→creaseで消せたので 角の部分は「点」と思っていました
今後 またこのようなことがあれば問題部分を拡大して原因をよく考えたいと思います
丁寧に解説してくださり有難うございました