説明しようとして、返って混乱した内容になってしまい、
大変申し訳ありません。
詳しく分析ありがとうございます。
＞おそらく、それで元のFlatColorであった部位と、編集をしたいと思ってマテリアルを切り替えたらFlatColorとの境界がなくなったゆえの質問でしょうか？
まさにこのとおりです。
「フラットカラーには、Aというマテリアルを表示したまま、
Bのマテリアルのモディファイアを動かしたい」
と言ったほうが、簡潔だったかもしれません。
お詫び申し上げます。
（ちょうど動画の６秒あたり。chromeの調整時に、回りのフラットカラーをクロム化したくないということでした。）
おっしゃられた通り、原理的にそもそも不必要なことをやっているような気がしてまいりました。
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＞マテリアルAで全体が塗りつぶされているものをレンダリング→マテリアルBで全体が塗りつぶされているものを次にレンダリング→画像として双方を書き出して、Photoshopのほうで好きにコンポジットして調整する。という風な流れのほうが良いと思います。
具体的な代替フローのご提案ありがとうございます！
どうしても１つのソフトでなにかしようと思い、頭が凝り固まってしまうようです。
こちらでやらせていただきます。ありがとうございました！
